A mudança de versão da NF-e para a 3.10 é bem simples.
Para alterá-la vá até o menu Configurações > Filiais > NF-e, e selecione a opção 3.10 no campo em destaque.

Figura 01 - Configurações filiais - aba NF-e
Vale ressaltar, que ao ativar a 3.10 do lado direito no canto aparece a opção "Enviar NF-e de modo síncrono (apenas versão 3.10)" |
Fonte: http://www.flexdocs.com.br/guiaNFe