Existe uma configuração padrão do Windows 7 para a correção dos erros internos que restaura a Área de Trabalho, com isso fazendo sumir todos os atalhos.

Para solucionar o erro vá no menu do painel de controle do Windows na opção Alterar configurações de solução de problemas, mude o campo "Ativado" para "Desativado".

Segue o passo a passo para solução e retorno de todos os atalhos.

Passo 01

Selecione o Menu iniciar , e  clique na opção Painel de controle:

Figura 01 - Menu Inicial

Passo 02 

Aparecerá a seguinte tela.

Figura 02 - Painel de Controle

Caso não esteja nessa tela, mude a exibição dos itens para "Categoria", e  clique na opção "Encontrar e corrigir problemas":

Passo 03

No canto esquerdo,  clique em "Alterar Configurações":

Figura 03 - Alterar Configurações

Passo 04

Altere a opção "Ativado" para "Desativado".

Figura 04 - Alterar Configurações de Solução de Problemas

Após isto confirme  clicando em "OK".

Pronto! Agora é só reiniciar a maquina, para as configurações serem salvas.