No Linx Farma Big a partir da versão 2.6.4.0 passa a ter a funcionalidade para conceder descontos por quantidade por filial.
Vá no menu Cadastros > Produtos > Produtos ou pelo menu rápido 
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Pesquise o produto que deseja conceder desconto.
Após ter selecionado o produto 
clique na aba 
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Figura 01 - Desconto Quantidade
Em seguida 
clique em 
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Figura 02 - Adicionar Desconto
Na tela abaixo poderá ser escolhido o tipo de desconto que queira conceder :
- Definir percentual de desconto
- Definir valor de venda final desejado
No exemplo abaixo foi utilizado Definir percentual de desconto conforme indica figura abaixo, pode-ser definir o desconto por valor de venda também selecionando Definir valor de venda final desejado.
Figura 03 - Desconto quantidade
Em Quantidade comprada é definido em cima de quantas unidades compradas irá conceder o desconto como mostra detalhe 
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Percentual de desconto informa de quanto será o desconto. como detalhe 
Se optar por Definir valor de venda final desejado, o valor fixado no campo percentual de desconto não será o valor aplicado, o desconto é pego pelo preço base, essa tela serve apenas para definir o percentual do desconto, ou seja, será levado em consideração as regras de desconto utilizados na loja.
Após definir o tipo de desconto 
clique em 
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Note que o desconto é dado apenas na filial em que está sendo cadastrado.
Se utilizar escritório será possível definir os descontos para cada filial individualmente.