Indiferente da tributação do cliente, deve constar no CF a linha informando o quanto de imposto já foi pago por toda sua cadeia produtiva até o momento desta venda.
O destaque informado não significa que o lojista está pagando aquele valor, e sim o quanto já foi tributado em sua cadeia produtiva.
Conheça um pouco mais sobre as configurações acessando o ppt abaixo ou assista o vídeo: http://lector.lectortec.com.br/lector-studio-web/watch?s=-10-3D4C-167970-7335-6151-4170-78257D43-80-33-23-19-3C047F-60