Solução Rápida- Verifique se existem entregas pendentes com os produtos constantes na nota, e encerre as mesmas.
Solução Detalhada
01 - Ao gerar a nota para empresa em um determinado período onde constam os lançamentos marcados (F5) ou todos os lançamentos (F6), 
clicando no botão 
ou pela tecla de atalho F10 abre-se a tela de "Manutenção de Notas Fiscais" onde constam os produtos e valores de acordo com os lançamentos marcados na tela anterior
02 - Se estiverem faltando produtos na hora da geração da NF-e verifique esses produtos faltantes se não estão como entrega pendente, pois esse processo impede a emissão da nota.
03 - Caso esteja pendente dirija-se a tela de vendas coloque o usuário 901 controle de entregas e finalize essas entregas pendentes com a tecla F3.
04 - Após esse procedimento pode-se gerar a nota novamente.