Figura 01 - Erro na Geração da Entrada do Arquivo SPED e Sintegra
Solução Rápida- Verifique em Cadastros > Fiscais > C.F.O.P.´ s se possui algum CFOP cadastrado duas vezes.
- Caso possua apenas deixe um CFOP.
- Feito os ajustes gere a entrada ou o arquivo novamente.
Solução Detalhada
01 - Vá até o Linx Farma Big no menu Cadastros > Fiscais > C.F.O.P.´ s.
02 - Será visualizado na tela todos os CFOP´s cadastrados em ordem de CFOP.
03 - Verifique se existe algum CFOP repetido, ou seja, cadastrado duas vezes.
04 - 
Clique no registro duplicado e seguida no botão 
05 - Gere a nota de entrada, ou o arquivo do SPED ou Sintegra novamente e verifique se o erro foi solucionado.