Esta melhoria está disponível a partir da versão 3.0.1.6.
A partir da versão 3.0.1.6 foi incluído a opção de filtro nas colunas na grade da tela de Manutenção de Preços por Filial, como utilizado em outras telas do sistema, como no cadastro de produtos, grupos, entre outros.
Para utilizar esta nova opção, vá ao menu Cadastros > Produtos > Preços nas filiais.
Feito isso, realize os filtros como habitualmente é feito e 
clique com o botão direito do mouse sobre a coluna que deseja para visualizar os filtros.
Figura 01 - Exemplos de Filtros
Para saber mais sobre Preços Filiais, acesse o artigo Melhorias no Cadastro de Preços Filiais.