Indo em Operacional > Administração de Produtos Controlados no botão    opção "Gerar arquivo de Inventário",
 

Figura 01 - Gerar Arquivo de Inventário
 
Serão visualizados todos os produtos com estoque que serão gerados no inventário inicial.
Os produtos corretos estarão com o sinal de check verde  , os com  possuem alguma divergência relativa ao Controle Especial, Lote, ou Registro MS.
O filto pode ser feito separado através das opções acima
 

Figura 02 - Geração de Arquivo SNGPC

Erros registro MS

Para corrigir o erro relativo ao registro ms,  clique duas vezes sobre o produto para que seja aberto o cadastro. Com o cadastro aberto, vá até a aba "Inf. Medicamento" e coloque o registro ms, salve o registro e feche a tela.
 

Figura 03 - Correção Registro MS

Erros lote

O erro de lote ocorre devido ao estoque do produto estar um valor, e somando o estoque dos lotes está outro, por exemplo, o produto tem 3 em estoque, porém em lote 2 em estoque.
 

Figura 04 - Erro de Lotes

 
Caso o ESTOQUE DO PRODUTO esteja correto e apenas o ESTOQUE DO LOTE errado,  clique duas vezes sobre o produto e aperte a tecla F10 ou vá até o menu Manutenção > Acertar Estoque de Lotes, acerte o estoque dos lotes, de modo que fique igual ao estoque do produto.

Figura 05 - Alterar Estoque do Lote

 
Após alterar feche a tela de produtos, porém dessa vez, a tela para gerar o arquivo de inventário precisa ser reaberta para que o estoque seja atualizado, caso contrário o erro vai permanecer mesmo com o produto corrigido.
Caso o estoque do produto esteja errado,  clique no botão  e localize o produto.
Com o produto encontrado, coloque o valor correto no campo "estoque", em seguida vai aparecer a tela de lotes, coloque a quantidade correta de cada lote no campo "Qtde Contado", assim que alterar é só voltar na tela de gerar arquivo de inventário novamente.
  

Figura 06 - Acerto de Lotes
 

Erros Ctrl. especial

Este erro ocorre devido ao produto estar como psicotrópico e antimicrobiano, para corrigir  clique duas vezes, e coloque o controle especial correto, se for antimicrobiano, coloque como antimicrobianos no campo "controle especial" da aba outros dados, e tire do grupo controlado.
Se o produto for psicotrópico, deixe-o no grupo de controlado e na aba outros dados, campo controle especial coloque "sem controle especial". Em seguida feche a tela de cadastro
 

Figura 07 - Cadastro Grupo Controlado