Para o Cadastro de Produtos vale uma observação, as configurações tributárias já existem, apenas foi adicionada mais uma opção na aba Informações Fiscais (Cadastros > Produtos > Produtos).
 

Figura 01 - Informações Fiscais do Cadastro de Produtos
 
As seções CST - PIS e CST - COFINS já existem também, apenas foi adicionada a diferenciação das operações de Entrada e Saída.
 

    Nota

Se desejar visualizar todas as CST's possíveis, tanto de Entrada quanto de Saída, que podem ser utilizadas clique na interrogação  existente na frente de cada campo.