Sim, é possível bloquear ou permitir esse procedimento, fica a critério da necessidade do usuário.
Para conseguir bloquear o desconto para que apenas o usuário que efetuou a cesta (pré-venda) consiga dar o desconto, vá ao menu Configurações > Filiais > Venda > Configurações de Descontos, Senhas e Permissões e desmarque a opção Permite alt. desc. na cesta com usuário diferente.
Figura 01 - Bloqueio de Alteração de Desconto