Da mesma forma como é feito na transmissão na tela inicial da página do SNGPC 
clique na opção Finalizar Inventário.
Defina o motivo da finalização, confirme o código e em seguida no botão 
.
Figura 01 - Finalizar Inventário
Após finalizar o inventário outro poderá ser enviado.
Dúvidas de como gerar o Inventário Inicial ? Verifique o artigo Como gerar o inventário inicial no SNGPC.
Dúvidas de como Enviar o Arquivo de Movimentação ? Verifique o artigo Como gerar o arquivo de movimentação para o SNGPC.